view release on metacpan or  search on metacpan

test/superideal_0.3.ali  view on Meta::CPAN

# built by filtered_ali
# built by filtered_ali
# built by filtered_ali
>Arabidopsis thaliana_3702@22101
 ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X?X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X...
>Chlamydomonas reinhardtii_3055@22762
AVVGDLEKRFVALLAAVLKYLDNLTGTVASELTKVDIEEKAGAKNELLVKEKEANDLYAEKFLKPSFQDDASNKFVTEALMECIIIGIYRLKVSIEKKEEMKAQLLTVVDANNTVPITADGWIPDVKTFNDAADATVMFPKNVSNTGLCIQVEKAKLFNETVDRGSIMSVTNIETFPSSLTAGYRIIVEAAMHACEIQRLTVAYVEHAYAERLGINLNNFWYAQPMTGEEAEMDECSNVCDVVIVAALVP...
>Chondrus crispus_2769@21660
TTIKDIAKRLVCLKTSVIKFMEALSDSAATQLTMAPIGTKISGANDVTVKTKDANDFFGAAHLKPSLEAATSDAFAGDSLLQVLIIGVLKLNVSLEREVKTEASIITVLAADNVTSVDSDGWQEDTKLIQNEKECTIMMEKKFADTDLCIKLERKTALSTLPLHASLHSATPLRPLRTYDAIHLGLAIPGSLSLLSVVASKALHCDGSFHAKRFLELLSRFECEKGNASARQLPGMEGGVQVVILTFMFR...
>Cyanophora paradoxa_2762@11572
LAVKNLKKRFICLMKAVIQYASKVTSTAASELKKTNIEESAAASEDVIVPEKDANDLYGAAYLKPSFEEAADEVLVGESLLNCLII*VYRLPTSVEKKEEVKAEILTLLDPENVVDADKDGWIPKIESFSKASDATIMFDKKFADLELCKKLE ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ????X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??...
>Guillardia theta_55529@17291
 ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X?X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X...
>Ostreococcus lucimarinus_242159@23601
AKVGDLKQTFVCMLNAILEYAKNVTNTGASEKTKVDVEAKAASPNSVCTKEKDGSTIFAEKYCKTNFQDDASNEFCGESLLQTIILGIYLKSVAIDKEMAKEAKILTVVAEDKIVSVDNEGWIPDLKAFQGENECSIMMDAKFGDTNL*IKLDKKKALARVLDEGAIMAGKKVATFPSAMTIGLRIVIESALHAMEMQKLTVAMAEHAYSQRLGLNVDDVIVCQPETGEMAEVDTVSSAVDICVVAALVP...
>Pyropia yezoensis_2788@17320
TAIKDLAKRLVCLKTSIIEYTAALSSAATSELKMAPIGAEISGSNDVTVKTADANDMFGAEFLRPSLEAAASNKFAGESMLDVLVIVVLRLSTSIEKEEEIAKKIIVVAAPDKLVSVDADDTQPKTELINAEADCTLAFDATYANTEVATKLE ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ????X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??...
>Selaginella moellendorffii_88036@22200
 ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X?X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X...
>Arabidopsis thaliana_3702@22101
 ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X?X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X...
>Chlamydomonas reinhardtii_3055@22762
AVVGDLEKRFVALLAAVLKYLDNLTGTVASELTKVDIEEKAGAKNELLVKEKEANDLYAEKFLKPSFQDDASNKFVTEALMECIIIGIYRLKVSIEKKEEMKAQLLTVVDANNTVPITADGWIPDVKTFNDAADATVMFPKNVSNTGLCIQVEKAKLFNETVDRGSIMSVTNIETFPSSLTAGYRIIVEAAMHACEIQRLTVAYVEHAYAERLGINLNNFWYAQPMTGEEAEMDECSNVCDVVIVAALVP...
>Chondrus crispus_2769@21660
TTIKDIAKRLVCLKTSVIKFMEALSDSAATQLTMAPIGTKISGANDVTVKTKDANDFFGAAHLKPSLEAATSDAFAGDSLLQVLIIGVLKLNVSLEREVKTEASIITVLAADNVTSVDSDGWQEDTKLIQNEKECTIMMEKKFADTDLCIKLERKTALSTLPLHASLHSATPLRPLRTYDAIHLGLAIPGSLSLLSVVASKALHCDGSFHAKRFLELLSRFECEKGNASARQLPGMEGGVQVVILTFMFR...
>Cyanophora paradoxa_2762@11572
LAVKNLKKRFICLMKAVIQYASKVTSTAASELKKTNIEESAAASEDVIVPEKDANDLYGAAYLKPSFEEAADEVLVGESLLNCLII*VYRLPTSVEKKEEVKAEILTLLDPENVVDADKDGWIPKIESFSKASDATIMFDKKFADLELCKKLE ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ????X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??...
>Guillardia theta_55529@17291
 ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X?X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X...
>Ostreococcus lucimarinus_242159@23601
AKVGDLKQTFVCMLNAILEYAKNVTNTGASEKTKVDVEAKAASPNSVCTKEKDGSTIFAEKYCKTNFQDDASNEFCGESLLQTIILGIYLKSVAIDKEMAKEAKILTVVAEDKIVSVDNEGWIPDLKAFQGENECSIMMDAKFGDTNL*IKLDKKKALARVLDEGAIMAGKKVATFPSAMTIGLRIVIESALHAMEMQKLTVAMAEHAYSQRLGLNVDDVIVCQPETGEMAEVDTVSSAVDICVVAALVP...
>Pyropia yezoensis_2788@17320
TAIKDLAKRLVCLKTSIIEYTAALSSAATSELKMAPIGAEISGSNDVTVKTADANDMFGAEFLRPSLEAAASNKFAGESMLDVLVIVVLRLSTSIEKEEEIAKKIIVVAAPDKLVSVDADDTQPKTELINAEADCTLAFDATYANTEVATKLE ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ????X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??...
>Selaginella moellendorffii_88036@22200
 ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X?X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X...
>Arabidopsis thaliana_3702@22101
 ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X?X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X...
>Chlamydomonas reinhardtii_3055@22762
AVVGDLEKRFVALLAAVLKYLDNLTGTVASELTKVDIEEKAGAKNELLVKEKEANDLYAEKFLKPSFQDDASNKFVTEALMECIIIGIYRLKVSIEKKEEMKAQLLTVVDANNTVPITADGWIPDVKTFNDAADATVMFPKNVSNTGLCIQVEKAKLFNETVDRGSIMSVTNIETFPSSLTAGYRIIVEAAMHACEIQRLTVAYVEHAYAERLGINLNNFWYAQPMTGEEAEMDECSNVCDVVIVAALVP...
>Chondrus crispus_2769@21660
TTIKDIAKRLVCLKTSVIKFMEALSDSAATQLTMAPIGTKISGANDVTVKTKDANDFFGAAHLKPSLEAATSDAFAGDSLLQVLIIGVLKLNVSLEREVKTEASIITVLAADNVTSVDSDGWQEDTKLIQNEKECTIMMEKKFADTDLCIKLERKTALSTLPLHASLHSATPLRPLRTYDAIHLGLAIPGSLSLLSVVASKALHCDGSFHAKRFLELLSRFECEKGNASARQLPGMEGGVQVVILTFMFR...
>Cyanophora paradoxa_2762@11572
LAVKNLKKRFICLMKAVIQYASKVTSTAASELKKTNIEESAAASEDVIVPEKDANDLYGAAYLKPSFEEAADEVLVGESLLNCLII*VYRLPTSVEKKEEVKAEILTLLDPENVVDADKDGWIPKIESFSKASDATIMFDKKFADLELCKKLE ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ????X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??...
>Guillardia theta_55529@17291
 ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X?X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X...
>Ostreococcus lucimarinus_242159@23601
AKVGDLKQTFVCMLNAILEYAKNVTNTGASEKTKVDVEAKAASPNSVCTKEKDGSTIFAEKYCKTNFQDDASNEFCGESLLQTIILGIYLKSVAIDKEMAKEAKILTVVAEDKIVSVDNEGWIPDLKAFQGENECSIMMDAKFGDTNL*IKLDKKKALARVLDEGAIMAGKKVATFPSAMTIGLRIVIESALHAMEMQKLTVAMAEHAYSQRLGLNVDDVIVCQPETGEMAEVDTVSSAVDICVVAALVP...
>Pyropia yezoensis_2788@17320
TAIKDLAKRLVCLKTSIIEYTAALSSAATSELKMAPIGAEISGSNDVTVKTADANDMFGAEFLRPSLEAAASNKFAGESMLDVLVIVVLRLSTSIEKEEEIAKKIIVVAAPDKLVSVDADDTQPKTELINAEADCTLAFDATYANTEVATKLE ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ????X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??...
>Selaginella moellendorffii_88036@22200
 ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X?X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X ??X...