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Drosophila_mauritiana_AAG25968.1	???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????MP-------------AIGIDLGTTYSCVGVYQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDPAKNQVAMNPRNTVFDAKRLIGRKYDDPKIAEDMKHWPFKVVS-DCG-KP...
Drosophila_mauritiana_AAG25969.1	???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????MP-------------AIGIDLGTTYSCVGVYQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDPAKNQVAMNPRNTVFDAKRLIGRKYDDPKIAEDMKHWPFKVVS-DCG-KP...
Drosophila_melanogaster_AAG26888.1	???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????MP-------------AIGIDLGTTYSCVGVYQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDPAKNQVAMNPRNTVFDAKRLIGRKYDDPKIAEDMKHWPFKVVS-DGG-...
Drosophila_melanogaster_AAG26900.1	???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????MP-------------AIGIDLGTTYSCVGVYQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDPAKNQVAMNPRNTVFDAKRLIGRKYDDPKIAEDMKHWPFKVVS-DGG-...
Arabidopsis_thaliana_AAG51030.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MAGKGE------------------------G------------PAIGIDLGTTYSCVGVWQH---DR-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRYSDPSVQADKSHWPFKVVS-GPGEKPM...
Arabidopsis_thaliana_AAG51503.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MAGKGE------------------------G------------PAIGIDLGTTYSCVGVWQH---DR-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDAAKNQVAMNPVNTVFDAKRLIGRRFSDASVQSDMKFWPFKVTP-GQADKPM...
Mus_musculus_BAA04548.1	??????????????????????????MISASR--------AAAARLVGTAA------SRSPAAARPQDGWNGLSHEAFRFVSRRDYASEAIKG------------AVVGIDLGTTNSCVAVMEG----KQAKVLENAEGARTTPSVVAFTADG--------ERLVGMPAKRQAVTNPNNTFYATKRLIGRRYDDPEVQKDTKNVPFKIVR-ASNGDAWVEAHG---...
Schizosaccharomyces_pombe_BAA12279.1	???????????????????????????????????????????????????????????????MSE------------------------VYE------------GAIGIDLGTTYSCVAVWET---AN-VEIIPNDQGARTTPSFVAFTET---------ERLVGDAAKNQAAMNPRNTVFDAKRLIGRRYEDPETQKDIKHWPFKVID-NN...
Aspergillus_oryzae_BAA82597.1	??????????????????????????????????MARLSSRNGAAKPFTAWTTIFYLLLVFIAPLAFFGTA------HA---EED-SVQDNYG------------TVIGIDLGTTYSCVGVMQN---GK-VEILVNDQGNRITPSYVAFTDE---------ERLVGDAAKNQYAANPVRTIFDIKRLIGRKYDDKDVTKDTKNFPFKVVN--KDGKPVVK...
Capra_hircus_BAA85389.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MSA--------------------------RG------------PAIGIDLGTTYSCVGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVS-EGG-KPKVQVEYKGE...
Arabidopsis_thaliana_BAA97012.1	MASSAAQIHILGGIGFPTSSSSSSTKNLDNKTNS-IPRSVFFGNRTSPFTTPTS----AFLRMGRRNNN-----------ASRYTVGPVRVVNE-----------KVVGIDLGTTNSAVAAMEG----GKPTIVTNAEGQRTTPSVVAYTKSK--------DRLVGQIAKRQAVVNPENTFFSVKRFIGRRMN--EVAEESKQVSYRVIK-DENGNVK...
Arabidopsis_thaliana_BAB08435.1	?????????????????????????????????????????MARSFGANSTVVLAIIFFGCLFAFSTA-------------KEEATK----LG------------SVIGIDLGTTYSCVGVYKN---GH-VEIIANDQGNRITPSWVGFTDS---------ERLIGEAAKNQAAVNPERTVFDVKRLIGRKFEDKEVQKDRKLVPYQIVN--KDGKPY...
Oreochromis_mossambicus_CAA04673.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MQL--------------------------KG------------VAIGIDLGTTYSCVGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVALNPSNTVFDAKRLIGRKFDEPVVQADMKHWPFKVIS-DGG-...
Encephalitozoon_cuniculi_CAA10035.1	????????????????????????????????????????????????????????MSNADAPSR-------------------------KFS-----------SSIIGIDLGTTNSCVSVIKD----GKPVIIENQEGERTTPSVVSILK---------DEVVVGTQARNRILMHPRNTIFASKRLIGRKFGDPEVEKYVKGLPFDTMS-HCN...
Schizosaccharomyces_pombe_CAA20787.1	???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????MS------------KSIGIDLGTTYSCVGHFSN---NR-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPHNTIFDAKRLIGRKFDDPEVQSDMKHWPFKVIS-KD...
Schizosaccharomyces_pombe_CAA21244.1	???????????????????????????????????????????????????????????????MSE------------------------VYE------------GAIGIDLGTTYSCVAVWET---AN-VEIIPNDQGARTTPSFVAFTET---------ERLVGDAAKNQAAMNPRNTVFDAKRLIGRRYEDPETQKDIKHWPFKVID-NN...
Xenopus_laevis_CAA25576.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MAT--------------------------KG------------VAVGIDLGTTYSCVGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQCDLKHWPFQVVS-DEG-KPKVKVEYK...
Trypanosoma_cruzi_CAA30115.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MTYEG---------------------------------------AIGIDLGTTYSCVGVWQN---ER-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDAAKNQVAMNPRNTVFDAKRLIGRKFSDPVVQSDMKHWPFKVIT-KGDDKPVIQV...
Rattus_norvegicus_CAA33735.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MSA--------------------------RG------------PAIGIDLGTTYSCVGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRKFEDATVQSDMKHWPFRVVS-EGG-KPKVQV...
Homo_sapiens_CAA36061.1	?????????????????????????????????????????????????????????????MQAP--------------------------RE------------LAVGIDLGTTYSCVGVFQQ---GR-VEILANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLVGDAAKSQAALNPHNTVFDAKRLIGRKFADTTVQSDMKHWPFRVVS-EGG-KPKVPVSYRGE...
Leishmania_donovani_CAA36551.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MTFDG---------------------------------------AIGIDLGTTYSCVGVWQN---ER-VDIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDAAKNQVAMNPHNTVFDAKRLIGRKFNDSVVQSDMKHWPFKVTT-KGDDKPMI...
Kluyveromyces_lactis_CAA38516.1	????????????????????????????????????MFSARKSSVGWLVSSLAVFYVLLAVIMPIALTGSQ------SSRVVARAAEDHEDYG------------TVIGIDLGTTYSCVAVMKN---GK-TEILANEQGNRITPSYVSFTDD---------ERLIGDAAKNQAASNPKNTIFDIKRLIGLQYNDPTVQRDIKHLPYTVVN--KGNKPY...
Kluyveromyces_marxianus_CAA42589.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MAEG------------------------VFP------------GAIGIDLGTTYSCVATYEN---S--VEIIANEQGNRVTPSFVAFTPE---------ERLIGDAAKNQAALNPKNTVFDAKRLIGRRFDEESVQSDMKTWPFKVID-SNG-...
Daucus_carota_CAA42685.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MASKG-------------------------G------------KAIGIDLGTTYSCVGVWQN---DR-VEIIANDQGNRTTPSYFAFTDT---------SRLIGD-AKNQVAMNPSNTVFDAKRLIGRRFNHPSVQSDMKLWPLQVIP-GPGEKPMIVVNYKG...
Paracentrotus_lividus_CAA43653.1	??????????????????????????????????????????????????????????????ME---------------------------SG------------PAIGIDLGTTYSCVGVFQN---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDAAKNQVAMNPTNTIFDAKRLIGRRFNDSSIQADMKHWPFRVIN-KDG-KP...
Glycine_max_CAA44620.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MATKE-------------------------G------------KAIGIDLGTTYSCVGVWQN---DR-VEIIPNDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRRFSDSSVQNDMKLWPFKVGG-SPCDKPMIVVNYKGE-...
Leishmania_major_CAA45498.1	???????????????????????????MFARR--------VCGSAAASAAC-----------LARHES--------------------QKVQG------------DVIGVDLGTTYSCVATMDG----DKARVLENSEGFRTTPSVVAFKGS---------EKLVGLAAKRQAITNPQSTFYAVKRLIGRRFEDEHIQKDIKNVPYKIVR-AGNGDAWVQDG...
Oryza_sativa_CAA47948.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MAGKGE------------------------G------------PAIGIDLGTTYSCVGVWQH---DR-VEIIANDQGNRTTPSYVGFTDS---------ERLIGDAAKNQVAMNPINTVFDAKRLIGRRFSDASVQSDIKLWPFKVIA-GPGDKPMIVVQYKGE...
Pisum_sativum_CAA49147.1	MASSA-QIHGLGTASFS-SLKK--PSSISGNSKT-----LFFGQRLNSNHSPFT--RAAFPKLSSKT-------------FKKG--FTLRVVSE-----------KVVGIDLGTTNSAVAAMEG----GKPTIITNAEGQRTTPSVVAYTKNG--------DRLVGQIAKRQAVVNPENTFFSVKRFIGRKMS--EVDEESKQVSYRVIR-DDNGNVKLDCPAI-...
Leishmania_major_CAA49479.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MS---------------------------ST------------NAIAIDLGTTYSCVGVFKN---EQ-VDIIANDQGNRTTPSYVAFTET---------ERLNRRCAKNQVAMNPSNTVFDAKRMIGRKFDDPDLQSDMKHWPFKVIV-KDG-KPVISVE...
Rattus_norvegicus_CAA53140.1	???????????????????????????????????????????????????????????????MA--------------------------KK------------TAIGIDLGTTYSCVGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDANGLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVVN-DGD-KPKVQV...
Phytophthora_cinnamomi_CAA53369.1	????????????????????????????????????????????????MNLSKILFMAAAAFAGAVVA-------------EDAKGP----RG------------PVIGIDLGTTYSCVGIYKD---QK-VEIIANDQGNRITPSYVAWDSN-D-------ERLIGDGAKNQATINPEKTLFDVKRLIGRKYNDKSVQADKKLLPYLLVN--KDGK...
Rattus_norvegicus_CAA54423.1	???????????????????????????????????????????????????????????????MA--------------------------KK------------TAIGIDLGTTYSCVGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVALNPQNTVFDAKRLIGRKFGDPVVQSDMKHWPFQVVN-DGD-KPKVQV...
Rattus_norvegicus_CAA54424.1	?????????????????????????????????????????????????????????????MAAN--------------------------KG------------MAIGIDLGTTYSCVGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRKFNDPVVQSDMKLWPFQVIN-EAG-KPKVLV...
Saccharomyces_cerevisiae_CAA55498.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MAEG------------------------VFQ------------GAIGIDLGTTYSCVATYES---S--VEIIANEQGNRVTPSFVAFTPQ---------ERLIGDAAKNQAALNPRNTVFDAKRLIGRRFDDESVQKDMKTWPFKVID-VDG...
Chlamydomonas_reinhardtii_CAA65356.1	???????????????MPVQQMT----SMRSQS--------LAGAPVAPVKAGRAG-------VSRRA-------------------LAVSVRAE-----------KVVGIDLGTTNSAVAAMEG----GKPTIITNAEGGRTTPSVVAFTKTG--------DRLVGQIAKRQAVVNPENTFFSVKRFIGRRMS--EVGSESTQVPYRVIE-D-...
Candida_albicans_CAA66308.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MADG------------------------VFQ------------GAIGIDLGTTYSCVATYDS---A--VEIIANEQGNRVTPSFVAFTSE---------ERLIGDAAKNQAALNPKNTVFDAKRLIGRAFDDESVQKDIKSWPFKVVE-SNG-QPLIEVE...
Emericella_nidulans_CAA67431.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MSDE------------------------VYE------------GAIGIDLGTTYSCVANYEG---TN-VEIIANEQGSYTTPSFVSFTDK---------ERLIGEAAKNQAAMNPQNTIFDIKRLIGRRYEDPIVKKDVESWPFKVVD-QGG-NPAV...
Pisum_sativum_CAA67867.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MATKE-------------------------G------------KAIGIDLGTTYSCVGVWQN---DR-VEIIPNDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPQNTVFDAKRLIGRRFSDESVQNDMKLWPFKVVP-GPAEKPMIVVNYKG...
Rattus_norvegicus_CAA68265.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MS---------------------------KG------------PAVGIDLGTTYSCVGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVN-DAG-RPKVQV...
Homo_sapiens_CAA68445.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MS---------------------------KG------------PAVGIDLGTTYSCVGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVN-DAG-RPKVQVEYKGE...
Leishmania_infantum_CAA69282.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MTFEG---------------------------------------AIGIDLGTTYSCVGVWQN---ER-VDIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDAAKNQVAMNPHNTVFDAKRLIGRKFNDSVVQSDMKHWPFKVTT-KGADKPVI...
Fugu_rubripes_CAA69891.1	?????????????????????????????????????????????????????????????MARA--------------------------RG------------TAIGIDLGTTYSRVGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTIPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVALNPSNTVFDAKRLIGRRLEDPTVQADIKHWPFQVVG-DGG-KPKIQVEYKG...
Fugu_rubripes_CAA69894.1	?????????????????????????????????????????????????????????????MSAA--------------------------KG------------LAIGIDLGTTYSCVGVSQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVALNPSNTVFDAKRLIGRRLEDPTAQADIKHWPFKVVG-DGG-RPKIQVVYKG...
Ceratitis_capitata_CAA70153.1	???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????MV-------------AIGIDLGTTYSCFGVFQH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDAAKNQVAMNPKNTVFDAKRLIGRKYDDPKIMEDVKHWPFKVVS-DGG-KPKIS...
Ciona_intestinalis_CAA72283.1	???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????MS------------TAVGIDLGTTYSCVGVFRH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFNET---------ERLIGDGAKDQVARNPENSIFDAKRLIGRNYNDPAVQKDKEHWPFKVVN-KNG-KPFLQ...
Aspergillus_niger_CAA73106.1	??????????????????????????????????MARIS-HQGAAKPFTAWTTIFYLLLVFIAPLAFFGTA------HA---QDETSPQESYG------------TVIGIDLGTTYSCVGVMQN---GK-VEILVNDQGNRITPSYVAFTDE---------ERLVGDAAKNQYAANPRRTIFDIKRLIGRKFDDKDVQKDAKHFPYKVVN--KDGKPHVKV...
Rhabdocalyptus_dawsoni_CAA74243.1	???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????MT-------------AIGIDLGTTYSCVGIFQH---GK-VEIIANNQGNRTTPSYVAFNDT---------ERLIGDAAKSQVSMNHANTVFDAKRLIGRKFDDPVIQADMKYWPFKVIN-EAG-R...
Pichia_angusta_CAA82570.1	???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????MS------------KAVGIDLGTTYSCVAHFVN---DR-VEIIANDQGNRTTPSFVAFTDT---------ERLIGDAAKNQAAMNPANTVFDAKRLIGRKFDDPEVQNDIKHFPFKVVE-KGG-KPHIQVEFK...
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Schizosaccharomyces_pombe_CAA93590.1	???????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????????MS------------KSIGIDLGTTYSCVGHFSN---NR-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPHNTIFDAKRLIGRRFNDPEVQSDMKHWPFKVIE-KD...
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Saccharomyces_cerevisiae_CAA98807.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MAEG------------------------VFQ------------GAIGIDLGTTYSCVATYES---S--VEIIANEQGNRVTPSFVAFTPE---------ERLIGDAAKNQAALNPRNTVFDAKRLIGRRFDDESVQKDMKTWPFKVID-VDG...
Caenorhabditis_elegans_CAB02319.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MS---------------------------KH------------NAVGIDLGTTYSCVGVFMH---GK-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDT---------ERLIGDAAKNQVAMNPHNTVFDAKRLIGRKFDDPAVQSDMKHWPFKVIS-AEGAK...
Caenorhabditis_elegans_CAB03871.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MS---------------------------TC------------KAIGIDLGTTYSCVGIYQN---GK-VEILANSEGNKTTPSYVAFTDT---------ERLVGDAAKDQAARNPENTVFDAKRLIGRRFDEETVQSDIKHWPFTVKG-KQG-K...
Schizosaccharomyces_pombe_CAB16585.1	????????????????????????????????????????????MKKFQLFSILSYFVALFLLPMAFA---------S----GDD-NSTESYG------------TVIGIDLGTTYSCVAVMKN---GR-VEIIANDQGNRITPSYVAFTED---------ERLVGEAAKNQAPSNPENTIFDIKRLIGRKFDEKTMAKDIKSFPFHIVN--D...
Schizosaccharomyces_pombe_CAB65812.1	?????????MISSRFTNVVRSGL--RFQSKGA--------SFKI---GASL------HGSRMTARWNSN-----------AS----GNEKVKG------------PVIGIDLGTTTSCLAIMEG----QTPKVIANAEGTRTTPSVVAFTKDG--------ERLVGVSAKRQAVINPENTFFATKRLIGRRFKEPEVQRDIKEVPYKIVE-HS...
Arabidopsis_thaliana_CAB79338.1	MASSAAQIHVLGGIGFASSSSS--KRNLNGKGGTFMPRSAFFGTRTGPFSTPTS----AFLRMGTRNGGG----------ASRYAVGPVRVVNE-----------KVVGIDLGTTNSAVAAMEG----GKPTIVTNAEGQRTTPSVVAYTKSG--------DRLVGQIAKRQAVVNPENTFFSVKRFIGRKMN--EVDEESKQVSYRVVR-DENNNVK...
Arabidopsis_thaliana_CAB80456.1	???????????????????MAS----VSAFKS--------VSANGKNSMFG-------KLGYLARPFC--------------------SRPVGN-----------DVIGIDLGTTNSCVSVMEG----KTARVIENAEGSRTTPSVVAMNQKG--------ELLVGTPAKRQAVTNPTNTIFGSKRLIGRRFDDPQTQKEMKMVPYKIVK-APNGDAW...
Arabidopsis_thaliana_CAB85986.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MAGKGE------------------------G------------PAIGIDLGTTYSCVGVWQH---DR-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDAAKNQVAMNPVNTVFDAKRLIGRRFSDASVQSDRQLWPFTIIS-GTAEKPM...
Arabidopsis_thaliana_CAB85987.1	??????????????????????????????????????????????????????????????MSGKGE------------------------G------------PAIGIDLGTTYSCVGVWQH---DR-VEIIANDQGNRTTPSYVAFTDS---------ERLIGDAAKNQVAMNPVNTVFDAKRLIGRRFSDSSVQSDMKLWPFKIQA-GPADKPM...
Arabidopsis_thaliana_CAB89371.1	?????MATAALLRSIRRREVVSS--PFSAYRC--------LSSSGKASLNSSYLG--QNFRSFSRAFS--------------------SKPAGN-----------DVIGIDLGTTNSCVAVMEG----KNPKVIENAEGARTTPSVVAFNTKG--------ELLVGTPAKRQAVTNPTNTVSGTKRLIGRKFDDPQTQKEMKMVPYKIVR-APNGDAW...
Kluyveromyces_lactis_CAC08199.1	?????????????????????????????????????????????MLR------LRPQTAKFFSNRCV---------------------SIAS-----------TKVIGIDLGTTNSAVAYIRDSNDKKSASIIENDEGQRTTPSVVAFDK-----NG---KVLVGAAAKRQSLINSENTFFATKRLIGRSFQDSETQKDLDVLPYTIVENKSNGQAY...
;
end;

begin assumptions;
	wtset MySoapWeights (VECTOR) = 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.29 0.2...
end;

begin trees;
	tree heat_shock_protein_70 = (((((((Blastocladiella_emersonii_AAA65099.1:0.1212,(((Schizosaccharomyces_pombe_CAA20787.1:0.07336,Schizosaccharomyces_pombe_CAA93590.1:0.13828)inode_32:0.14187[1],Paracoccidioides_brasiliensis_AAB53051.1:0.18877)inode_3...
end;